Diversité génétique des Xanthomonas oryzae du riz dans le bas-fond et en zone irriguée

Abstract

Le flétrissement bactérien et la strie foliaire sont deux maladies dévastatrices du riz et causés respectivement par Xanthomonas oryzae oryzae (XOO) et Xanthomonas oryzae oryzicola (XOC). Nous avons effectué une étude prospective sur une période de 10 mois allant de janvier à octobre 2023. L’objectif de cette étude était d’évaluer la diversité génétique des Xanthomonas oryzae du riz dans le bas-fond de Kita et en zone irriguée de Baguinéda. Une soixantaine de souches bactériennes a été isolée dans les différents types de système rizicole. L’ensemble de ces souches étaient du profil Xoc ; 44 souches de XOC (73,33%) ont été isolées avec les échantillons de Baguinéda et 16 souches (26,67%) avec ceux du bas fond de Kita. L’analyse MLVA-16 a révélé des différences génétiques entre les souches XOC isolées dans les 2 zones d’étude. La prédominance des Xanthomonas étaient élevées dans la zone irriguée que dans le bas-fond. Les différences génétiques observées sont probablement dû à l’écologie de la culture. Notre étude a ainsi montrée l’impact du système écologique sur la diversité de ces pathogènes