Caractéristiques virologiques et cliniques du SARS-CoV-2 dans les centres de prise en charge de la COVID-19 au Mali et en Guinée

Abstract

Découverte à Wuhan, en Chine, fin 2019, la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19), causée par le virus SAR-CoV-2, s'est propagée rapidement à travers le monde, a fait des millions de morts dans le monde et continue de menacer des millions de vies supplémentaires. Nous avons mené une étude transversale virologique et clinique au Mali et en Guinée dans le but de décrire le profilage virologique du SRAS-CoV-2 (séquençage du génome entier du SARS-CoV-2 a été réalisé à Chicago. Une analyse bio-informatique a été effectuée également à Chicago) dans les deux pays de l’Afrique subsaharienne. Des échantillons nasopharyngés ont été collectés auprès des participants dans les centres de prise en charge de COVID-19 au Mali (CHU du Point G et CHU de l’hôpital du Mali à Bamako) et en Guinée (CHU de l’hôpital National Donka à Conakry). Un total de 200 participants positifs au SARS-CoV-2 par RT-PCR ont été inclus dans cette étude, et un examen physique a été effectué par des médecins pour chaque participant, et des paramètres physiologiques clés ont été collectés. Les symptômes les plus fréquents remarqué au cours de notre l’étude étaient la fièvre, l’essoufflement, la toux, les courbatures, la faiblesse, la perte de gout, la perte d’appétit, les maux de tête. Les comorbidités les plus fréquents remarqué au cours de notre étude étaient : le diabète sucré, l’hypertension artérielle, l’obésité, les maladies cardiaques, les maladies respiratoires, les maladies rénales et les maladies du foie. Les variants identifiés étaient les suivants en Guinée : 20I (Alpha, V1), 20B, 20D, 20A, 19B, au Mali : 21D (Eta), 19B.