Etude microbiologique de l'eau de boisson à Dioro : Relation entre la malnutrition et le portage d'Escherichia coli.

Abstract

La présente étude portait sur la relation entre la malnutrition et les souches pathogènes d'E. coli isolées dans l'eau de boisson. Notre objectif était d'évaluer le niveau de risque lié à la présence d'Escherichia coli thermotolérant dans l'eau de boisson dans un contexte de malnutrition. C'était une étude cas-témoins de Novembre 2015 à Mai 2016, qui s'est déroulée dans la commune rurale de Dioro-Mali. L'étude a concerné 108 enfants répartis en deux groupes : 54 enfants malnutris et 54 enfants témoins. Un échantillon d'eau de boisson a été collecté dans chacune des familles de ces enfants. Deux techniques ont été utilisées : microbiologique (Aquagenx kit CBT) et le génotypage (PCR). Parmi les 108 échantillons d'eau de boisson, 88 ont été positifs par analyse microbiologique au kit CBT et ont été confirmés positifs par l'utilisation de l'ARN ribosomique 16S par PCR. L'identification des souches pathogènes par la PCR multiplex a été réalisée sur les 88 échantillons positifs au kit CBT en recherchant simultanément les 5 pathotypes d'E. coli. . Elle a permis d'obtenir les résultats ci-après : 11,36% (10/88) du gène vt2 (Pathotype enterohémorragique, EHEC), 1,13% (1/88) du gène eaeA (Pathotype enteropathogénique, EPEC), 1,13% (1/88) du gène est A (Pathotype enterotoxigenique, ETEC), 1,13% (1/88) du gène eltB (Pathotype enterotoxigenique, ETEC). Les gènes d'E. coli étaient plus détectés dans les eaux de boisson provenant des puits, soit 76,9% (10/i3). Les gènes détectés d'E. coli étaient plus représentés dans les échantillons d'eaux de boisson collectés chez les enfants malnutris, soit 84,6% (11/13). E. coli était présente dans 88/108 des échantillons. Les souches d'E, coli ont été plus détectées dans les échantillons d'eau qui présentaient un risque dangereux selon la classification de la potabilité de l'eau. La malnutrition était associée à la présence des souches d'E. coli de type enterohémorragique et enteropathogénique dans l'eau de boisson à Dioro