Évaluation de la résistance du VIH- 1 aux antirétroviraux chez les nouveau-nés de mères séropositives au Mali
Résumé
Au Mali, en 2016 le nombre de personnes adultes âgés de 15 ans et plus vivant avec le VIH était estimé à 110 000, les enfants de 0 à 14 ans restent touchés par cette pandémie avec 12000 enfants infectés. Dans cette population fragile, la résistance aux ARV est encore plus inquiétante et reste mal évaluée. Le but de cette étude était d'évaluer la résistance du VIH-1 aux antirétroviraux dans une population pédiatrique au Mali. L'étude a porté sur 108 DBS (VIH+) confectionnés à partir de sang prélevé chez des enfants âgés de 0 à 18 mois nés de mères séropositives au VIH-1. Les ADN proviraux ont été extrait par méthode chimique, puis amplifiés par PCR nichée et séquencés par la méthode de Sanger à l'aide du ABI 3500 genetic analyseur selon la technique ANRS au laboratoire de bactériologie virologie de l'INRSP.Les séquences des gènes de la RT, de la prot et de l'intégrase ont été analysées puis interprétés par la version récente de l'algorithme de Stanford. A l'issue de nos travaux, les résultats suivant ont été obtenu : Le sexe féminin était prédominant avec 47,2 %.L'âge médian était de 9 mois. Sur les 108 échantillons, 40gènes de reverse transcriptase, 29 gènes de protéases et 16 gènes d'intégrases ont pu être amplifiés. Le taux global de mutations de résistance associées aux différentes classes étudiées était de 16,66%. La présence d'au moins une mutation de résistance associée aux INNTI, aux INTI et aux IP était de 18,75%,12 ,5 %, 6.89% respectivement. Nous avons retrouvé des mutations de résistance associées aux INNTI, aux INTI et aux IP. Ainsi pour les INTI, les mutations M41L, M184V et Y115F ont été retrouvés avec une fréquence de 6,3% chacune ; pourles INNTI, les mutations K103N (12,5%), G190A (6,3%), V108I(6,3%), E138Q (6,3%), Y181C(6,3%), H221Y(6,3%) ont été retrouvés. Neuf mutations mineuresont été observées pour les IP (F53L, I50M, M46R, G48E, V32L V32I, D30N, avec 3,4% chacune)et deux mutations majeures V82F, N88D ont également été observés pour les IP avec 3,4% de fréquence. Le sous type CRF02_AG a été le plus fréquent à 84%. Ce travail a montré un niveau modéré de 16,66% de mutations de résistance associés aux différentes classes d'ARV.Les INNTI, restent la classe la plus touchée avec 18,75%.Nous n'avons enregistré aucune mutation majeure de résistance associées aux I.INT. Ainsi la faible résistance aux IP et l'absence de la résistance aux I.INT supportent l'utilisation de ces molécules chez les enfants.