Prévalence des variants du SARS-COV-2 chez les personnes positives au COVID-19 à Bamako, Mali.

Abstract

Courant décembre 2019, le monde a été frappé par une pandémie sans précédent. À l’origine de celle-ci, un virus de la famille des Coronaviridae; le SARS-COV-2, responsable d’une nouvelle pathologie affectant le système respiratoire humain : la maladie à Coronavirus encore appelée COVID-19. La propagation fulgurante de la maladie a l’échelle mondiale a provoqué une grosse crise sanitaire et économique internationale. De nombreuses études sont en cours en vue d’éradiquer cette maladie. Le séquençage génomique du SARS-COV-2 a révélé de nombreuses mutations au sein de son génome, notamment au niveau de sa glycoprotéine de surface : protéine S ou SPIKE ( Pic). La présente étude consistait à déterminer la prévalence des variants du SARS-COV-2 chez les personnes positives au COVID-19 à Bamako au Mali. Le test RT-PCR a été utilisé pour l’amplification de l’ARN viral avant son séquencage. En somme, le sexe masculin était beaucoup plus enclin à l’infection avec 56,79% des cas. Le variant 21J Delta avec 42% de cas détectés, était le plus répandu au Mali entre avril et octobre 2021. Les communes 4 , 5 et 6 étaient les zones du district de Bamako où l’infection (et particulièrement le variant Delta) a le plus circulé.