Étude de la séroprévalence du SRAS-CoV-2 dans une zone péri-urbaine et rurale de juillet 2020 à août 2021 : Sotuba et Donéguébougou, Mali
Résumé
Introduction : Nombreux sont les pays africains qui ont été identifiés comme étant très vulnérables à l'impact de la pandémie à COVID-19. Il est donc essentiel de comprendre l'épidémiologie locale de la maladie pour optimiser la gestion locale. Nous avons cherché à estimer la séroprévalence du SRAS-Cov-2 dans deux communautés maliennes (urbaine et rurale), et comprendre les facteurs associés à la maladie causée par ce virus. Méthodes : Entre juillet 2020 et août 2021, nous avons collecté des échantillons de sang ainsi que des informations démographiques, sociales, médicales et des symptômes autodéclarés auprès des participants âgés de 6 mois et plus sur deux sites d'étude lors de trois enquêtes. Les anticorps anti-SRAS-CoV-2 ont été mesurés à l'aide d'un test ELISA hautement spécifique à deux antigènes (Spike protéine et RDB), optimisé pour être utilisé au Mali. Nous avons calculé la séroprévalence ajustée pour chaque visite. Résultats : Au total, 95,01% (1623/1707) des participants ont effectué les 2 visites sur l’ensemble des 2 sites dont 97,84% (1089/1113) à Donéguebougou et 89,90% (534/594) à Sotuba. Pour la troisième visite, 78,96% (469/594) ont effectué ce suivi supplémentaire à Sotuba. Parmi les participants, 49,2 % (839/1707) étaient des hommes, et 32,7 % (558/1707) étaient âgés de <10 ans, 26,5 % (453/1707) étaient âgés de 10 à 17 ans, et 40,8 % (696/1707) étaient âgés de ≥18 ans. Le taux de détection des anticorps anti-SRAS-CoV-2 était le plus élevé à Sotuba et a nettement augmenté entre les 3 enquêtes (la séroprévalence ajustée est passée de 19.0% (IC 95 % : 14.2-23.8) à 70.4% (IC 95 % : 56.8-84.1) puis à 96,3%). Dans la communauté rurale de Doneguebougou, les anticorps anti-SAR-CoV-2 ont été détectés à un taux plus faible, mais l'augmentation était similaire entre les enquêtes 1 et 2 (la séroprévalence ajustée est passée de 5.0% (IC 95 % : 2.8-7.1) à 35.0% (IC 95 % : 27.9-42.1)). Conclusion : Cette étude a pu déterminer le taux de propagation de la COVID-19 dans la population de ces deux localités et montrer que l'épidémiologie de la Covid-19 au Mali pourrait être principalement subclinique. La séroprévalence des anticorps anti-SRASCoV-2 serait plus élevée dans les communautés urbaines que les communautés rurales. Ainsi, Une surveillance continue est nécessaire pour mieux adapter la lutter contre cette pandémie.