« Caractérisation Moléculaire des Pathovars de Escherichia coli Diarrhéagenique et des Gènes de Résistance aux Antibiotiques »

Abstract

Le but de cette étude était de déterminer la prévalence et l’épidémiologie des gènes de virulence et de résistance rencontrés dans les isolats cliniques de Escherichia coli diarrhéageniques au Centre Hospitalier Universitaire du Point G. Nous avons conduit une étude retroprospective, descriptive et analytique à cheval entre le laboratoire du CHU du Point « G » et le LBMA sur la période de janvier 2020 à décembre 2021 portant sur 98 souches cliniques de Escherichia coli. La technique de bactériologie classique a été utilisé pour l’indentification des souches de E. coli, la méthode de Salting out pour l’extraction du matériel génétique et la PCR multiplex pour la caractérisation des différents gènes. Cette étude nous a permis de mettre évidence la circulation des pathovars comme suit : ECEA (37,5%), ECEP (41,91%), ECET (19,10%), ECEH (1,47%) et ECEI (0,00%). La prévalence des gènes de résistance aux antibiotiques était comme suit : bêtalactamines (blaOXA 4,48%, blaSHV 7,00%, blaTEM 13,44%, blaCTXM 9,80%) ; Quinolone (qnrS1 18,20%) ; Chloramphénicol (catA1 2,80%) ; Tétracycline (tetA 6,16%) ; Kanamycine (aphA3 12,60%). De même les intégrons se présentaient dans des proportions suivantes : intl1 9,80%, intl2 7,00% et intl3 8,68%. Cette étude a permis de mettre en évidence une prévalence élevée de la circulation des pathovars de E. coli diarrhéagenique avec un niveau de résistance modérée aux antibiotiques.